本发明公开了一种分段式大功率高频高压变压器,包括磁芯,磁芯的外部包裹有绝缘骨架,绝缘骨架上依次绕制有初级绕组和次级绕组,初级绕组和次级绕组之间绕制有绝缘层。本发明还公开了一种分段式高频高压变压器的分段绕制方法,在原有的初、次级绕组分层设计的基础上,进一步减小了初、次级绕组的层间电压,从而降低了初、次级绕组的层间的绝缘指标。另外,高频高压变压器的分段式绕制方法能够有效地降低初、次级绕组的等效寄生电容以及初、次级绕组间的等效寄生电容,从而减小了传导EMI噪声。同时,本发明还提出了一种高频高压变压器的分段数设计方案,有助于减小高频高压变压器的体积,以及减小变压器的漏感。