本发明公开了一种冷链运输车制冷机组故障分析云服务系统,包括设置于冷藏车箱内部制冷机组的数据采集系统、云服务器及客户端,本发明还公开了冷链运输车制冷机组故障分析云服务控制方法,具体按照以下步骤实施:步骤1、参数设置;步骤2、建立数据库;步骤3、实现数据采集、传输、存储;步骤4、建立面向用户的服务:建立WebGIS服务、建立数据查询服务、建立故障诊断服务、建立最优解决预案服务、建立抢单服务、建立消息推送服务;步骤5、通过客户端向各类用户提供云服务,本发明解决了现有技术中存在的冷链运输车运行中制冷机组出现故障无法及时自动预警处理和缺乏有效服务的问题,针对不同用户提供个性化服务。