本发明公开的一种数字水准仪系统检定装置包括数字水准仪系统、竖直运动控制系统、激光干涉仪距离测量系统、气象传感系统以及计算机。本发明公开的一种数字水准仪系统检定方法包括:将水准标尺移动到初始位置;计算机分别控制数字水准仪、激光干涉仪各自获取测量数据,并利用气象传感系统获取大气参数数据;然后利用Edlen公式结合大气参数获得激光干涉仪的修正波长,再得到修正后的水准标尺的实际移动距离,建立数字水准仪系统的误差分布图,最后利用最小二乘法和线性回归方程你和出误差回归直线。本发明的一种数字水准仪系统检定装置及检定方法能够对数字水准仪系统进行自动化竖直检定,简化了检定步骤并提高了检定效率。