本发明公开了一种大功率高压除尘电源控制系统,包括开关控制模块,开关控制模块上分别连接有本地/远程切换开关、手动/自动切换开关、启动/停止开关、急停按钮、DSP板、FPGA板、中继器A、中继器B、中继器C、主中继器合/分开关及辅助中继器合/分开关,本地/远程切换开关、手动/自动切换开关、启动/停止开关及急停按钮依次连接,本地/远程切换开关、中继器A、中继器B及中继器C还均连接有信号指示灯,DSP板还分别连接触摸屏和FPGA板,FPGA板分别连接外部电源柜和霍尔电流传感器;本发明还公开了一种电源时差保护控制方法,本发明公开的控制系统能够集中发出多路信号控制多个模块,集成度及控制灵活性高。