本发明公开了一种配电网等效序阻抗纵联保护方法,包括以下步骤:利用在发生不对称故障下特有的负序电流的突变量进行保护的启动,采集的故障电压和故障电流进行序分量分解,求出正负序电压和电流的突变量,然后计算等效正负序阻抗以及等效序阻抗之比ρsf,ρDGf,得出ρf,当判断满足保护判据时,则可判定为配电网特定的线路发生了区内故障,保护装置发出保护动作信号作用于线路的断路器来双端切除该线路的故障;若不满足保护判据,则可判定为区外故障,则该段线路两侧的保护不动作。本发明针对分布式电源接入配电网,提供的方法能够有效可靠的判别线路的区内外故障,在实际工程中具有一定的应用价值。