本发明公开了基于微流控技术与线阵探测器的流式细胞仪，包括依次连接的微流控芯片，线阵探测器和数据处理装置；还包括有设置于微流控芯片正上方的光源，微流控芯片内部设置有直线型的主通道，主通道一端设置有样品入口，主通道另一端设置有样品出口，微流控芯片下表面与所述线阵探测器上表面贴合，主通道与线阵探测器之间形成夹角θ，且夹角θ满足如下关系：0°≤θ≤90°。本发明主要结合了微流控芯片多个微流控通道中细胞运动与传统的线阵探测器扫描成像特点，相对基于面阵探测器与微流控技术的流式细胞仪能够得到更高分辨率细胞图像，细胞流动计数更加准确、速度更快。
