本发明公开了一种基于微流控显微系统的细胞大小检测方法,将细胞稀释液通入微通道中,对图像采集软件采集到的单帧主通道的细胞初始图像进行捕获;然后对于捕获到的细胞初始图像,通过图像处理的方法对图像中的细胞进行分割得到单个细胞图像;最后基于分割出来的所有单个细胞图像统计细胞大小并且并绘制大小分布图,得到细胞大小的检测结果。本发明减小了算法对细胞大小检测带来的误差,增加了细胞大小检测的准确度,并且填补了利用基于微流控技术的无透镜显微系统进行细胞大小统计的空白,使得能够应用微流控系统进行细胞大小检测,尤其是对红细胞的大小检测能够为贫血类血液疾病的诊断提供参考。