本发明公开了一种水溶性透明超疏水涂料及其制备方法和应用,本发明的制备方法,首先采用无皂乳液聚合法制备出聚(疏水性单体‑无规‑亲水性单体)(P(A‑r‑B))微球,然后将含氟物质与均匀分散的P(A‑r‑B)微球反应制备氟化微球,最后氟化微球经水溶液透析得到氟化微球的水性超疏水涂料;本发明的应用方法,将表面处理过的基材浸泡于氟化微球悬浮液中,经纯度为99.5%的四氢呋喃洗涤后烘干得到透明超疏水涂层。本发明制备出的涂料具有水溶性超疏水的性能,制备工艺简单,浸泡技术简便,节能环保,适用于棉布、纸张、秸秆、木塑、石材、玻璃等基材表面。