本发明公开了一种PCR微卫星引物,包括引物位点1~10,引物位点的引物序列及退火温度。本发明还公开了一种PCR微卫星引物用于大黄鱼亲子鉴定的方法,首先,选择适宜的大黄鱼待测样品,提取大黄鱼待测样品的DNA;采用PCR微卫星引物位点1~10对大黄鱼待测样品的DNA进行PCR扩增,得到PCR扩增产物;在体积百分数为12%的聚丙烯酰胺胶上对PCR扩增产物进行电泳分离;最后统计PCR微卫星引物位点1~10中PCR扩增产物的基因型;根据基因型进行大黄鱼待测样品之间的亲子鉴定。解决了现有的大黄鱼近亲交配、种群遗传多样性下降的问题。