本发明公开了一种鲢标记放流和放流效果评价方法,具体为:将放流的鲢分为大个体鲢和小个体鲢,并在大个体鲢的腹腔内植入微卫星标,在小个体鲢的背鳍上固定外挂标;对被放流的鲢进行剪鳍条采样并且记录鲢的信息;利用微卫星标记技术鉴定每个鲢的遗传信息,统计每条被放流鲢的等位基因并构建样本遗传档案;对鲢进行放流后,在河流定点位置放置卫星信号接收器,收集卫星标信号,确定放流鲢活动范围,在捕捞期回捕放流区域内的鲢;对回捕的个体进行识别,统计回捕鲢中的放流个体的数量。该方法可以有效鉴定放流水域内被放流的鲢在该水域中鲢的占比,进而对鲢的放流效果进行评价,具有巨大的推广价值。