本发明公开了一种鲶鱼标记放流效果评价方法,具体为:将放流的鲶鱼分为大个体鲶鱼和小个体鲶鱼,并在大个体鲶鱼的腹腔内植入微卫星标,在小个体鲶鱼的背鳍上固定外挂标;对被放流的鲶鱼进行剪鳍条采样并且记录鲶鱼的信息;利用微卫星标记技术鉴定每个鲶鱼的遗传信息,统计每条被放流鲶鱼的等位基因并构建样本遗传档案;对鲶鱼进行放流后,在河流定点位置放置卫星信号接收器,收集卫星标信号,确定放流鲶鱼活动范围,在捕捞期回捕放流区域内的鲶鱼;对回捕的个体进行识别,统计回捕鲶鱼中的放流个体的数量。该方法可以有效鉴定放流水域内被放流的鲶鱼在该水域中鲶鱼的占比,进而对鲶鱼的放流效果进行评价,具有巨大的推广价值。