本发明公开的一种模拟近岸海水交换规律的耦合模型的建立方法,具体按照以下步骤实施:步骤1、对研究区域建立Mike21水动力模型;步骤2、根据研究区域实测水位数据对Mike21水动力模型进行率定;步骤3、对研究区域分别建立Mike21物质传输模型、Mike21粒子追踪模型,并将Mike21物质传输模型、Mike21粒子追踪模型与经过步骤2率定之后的Mike21水动力模型耦合,得到耦合模型。本发明公开的一种模拟近岸海水交换规律的耦合模型的建立方法,能够充分利用Mike21软件高效地模拟近岸海域水体交换规律。