本发明涉及一种双层堆叠式微波带通滤波器,包括从上至下依次设置的上金属层、上玻璃基板、中间金属层、下玻璃基板以及下金属层,其中,所述上金属层的相对侧壁上分别设置有第一金属片和第二金属片;所述上玻璃基板上设置有多个上玻璃基板通孔,其内部分别填充有第一金属导体柱;所述中间金属层上设置有第一辐射窗口和第二辐射窗口;所述下玻璃基板上设置有多个下玻璃基板通孔,其内部分别填充有第二金属导体柱。本发明的滤波器采用三维集成技术和玻璃基板,一方面显著减小了该滤波器结构的面积,另一方面玻璃基板可以消除高频电路中的涡流效应,使得本发明的滤波器的功耗显著降低,提高了滤波器的品质因数。