本发明公开了一种基于热管及热电制冷器的LTCC集成制冷系统,包括:热电制冷器、热管组件以及由下至上依次设置的下层瓷片、中层瓷片和上层瓷片;上层瓷片上开设有安装通孔;热电制冷器固设在所述安装通孔内;中层瓷片上开设有多个导热通孔;导热通孔中填充有金属柱;下层瓷片上开设有安装槽;热管组件位于安装槽内且与外部的冷却设备连接;金属柱的上端与热电制冷器的热端接触。本发明的基于热管及热电制冷器的LTCC集成制冷系统通过热电制冷器和热管组件能够快速有效的对热源芯片进行制冷,使热源芯片能够在合适的低温下持续工作,解决了LTCC基板散热差的问题,提高了LTCC基板的散热性能。本发明还公开了基于热管及热电制冷器的LTCC集成制冷系统的制作方法。