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一种DNA数据集植入模体搜索方法及其装置与存储介质

专利类型:
申请号/专利号:
CN201910181475.8
申请人(专利权人):
于强
行业类别:
技术成熟度:
公布时间:
证书状态:
授权
交易价格:
50000元
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摘要详情

技术摘要

权利要求书

技术附图

交易流程

委托经理人

本发明涉及一种DNA数据集植入模体搜索方法及其装置与存储介质,其方法包括:获取DNA序列大数据集、获取所述DNA序列大数据集的植入模体搜索参数;根据所述DNA序列大数据集、所述植入模体搜索参数得到第一k‑mer集,根据所述第一k‑mer集得到第一l‑mer集,根据所述第一l‑mer集得到第二l‑mer集;根据第一得分模型从所述第二l‑mer集确定所述植入模体。本发明通过APMS方法,不仅能够从DNA序列大数据集中搜索出植入模体,同时在找出植入模体的运行时间数量级地快速于其它植入模体搜索方法。

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