本发明公开了一种沟槽栅双层超结VDMOSFET半导体器件及其制备方法,方法包括:依次生长n+型衬底、第一n‑外延层、第一pn超结漂移区、第二n‑外延层;在第二n‑外延层内形成p型基区;刻蚀形成第一沟槽;在第一沟槽的表面生长栅极氧化膜;在第一沟槽开口处的p型基区表面形成n+源区;刻蚀形成第二沟槽;利用第二沟槽形成第二pn超结漂移区;对第二pn超结漂移区进行离子注入形成p+注入区;在第一沟槽形成栅极;在n+源区和p+注入区表面形成源极,在n+型衬底下表面形成漏极。本发明有效缓解了击穿电压、导通电阻和损耗之间的矛盾,获得高击穿电压,并降低导通电阻,从而提升了器件性能,且可以缩小器件尺寸,便于大批量生产。