本发明公开了一种基于免疫编码的干扰管理和安全传输方法及系统;该方法包括:期望发射机和干扰发射机之间共享信道状态信息和数据信息;所述期望发射机根据信道状态信息和干扰数据信息构造提供免疫能力的虚数据;所述期望发射机根据所述提供免疫能力的虚数据对待发送的期望数据进行免疫编码,得到免疫编码信号;所述期望发射机发送免疫编码信号;所述期望发射机对应的期望接收机收到包含所述干扰信号和所述免疫编码信号的混合信号,并将所述该混合信号进行匹配滤波,所述期望接收机对所述混合信号滤波后的结果进行最大似然接收,以恢复出所述期望数据,所述干扰信号至少包括干扰数据信息。