本发明公开了一种基于二叉树混洗的生物特征模板保护方法及装置，该方法包括：获取待验证生物特征图像；对待验证生物特征图像进行像素点插值变换，得到第一模板矩阵；根据第一模板矩阵生成待验证的哈希校验码；对第一模板矩阵进行基于二叉树混洗处理，得到第二模板矩阵；对第二模板矩阵进行特征提取，得到待验证的特征向量串；将待验证的特征向量串与预先存储的注册生物模板矩阵对应的注册特征向量串进行匹配，同时将待验证的哈希校验码与预先存储的注册哈希校验码进行匹配，并输出验证结果。本发明提供的基于二叉树混洗的模板保护方法具有较高的效率和安全性。
