1.一种燕麦50K SNP靶向捕获探针，其特征在于，包含燕麦50K SNP位点探针，所述燕麦50K SNP位点探针是根据燕麦50K SNP分子标记合成的单链DNA，所述50K SNP位点包括如下所示的核心SNP分子标记： 1～104：chr1A：5283582、7103302、10734851、10945761、11664332、14467396、15047396、16398486、21270926、25425155、29414961、75223307、101003855、115488498、135276592、148522929、202683424、205620149、222308771、229586249、234567116、240417456、253749877、281357546、293747404、298042526、298551987、304720100、308580466、315853787、316067487、317504915、323176649、323573314、326044569、331209279、331937768、331978174、340045388、342258714、346927231、352153597、352895025、353681133、353814760、354406639、356296360、357079009、359814991、360764207、361568511、364411537、366545162、368905078、370338339、370873141、371665959、371666020、378118472、378609831、381550595、381678547、382379106、383609412、385331788、387527211、387561633、388365359、390782899、391759928、392823534、396147375、401560695、405883242、407306848、407534418、408130557、415475150、420947480、430805639、451372954、461369888、462031762、472352616、484252481、488853414、495087041、499171795、502654285、506758067、507037483、509192469、509662645、515161916、515262213、517095456、522371782、525396862、527223945、528829545、533025127、539185410、540315630、540617233； 105～159：chr2A：2100930、4239492、10704631、10938210、13436858、14441332、18422955、32282364、39418692、59982919、60887086、70607983、75197819、89599242、104954798、112783291、130463628、132068088、135426392、217334034、242505005、266261884、274342752、296150888、316167952、317795068、330610398、332882630、335767331、340794839、344918901、345951965、348518457、351045498、354468810、358393070、359546799、365230751、367437482、376887627、381029377、382692023、386423751、388053059、392483868、392798434、396593342、414088827、417851447、420594190、420595093、424692775、427321507、442730057、446172245； 160～205：chr3A：1610216、6683114、8014312、10110259、10485169、14172173、14776263、17340560、20488584、21496967、26049655、32772758、33991651、35299853、38586125、44880561、54997130、58739452、62189906、85688337、94820162、114658260、116633323、128773290、151178376、200425079、280387479、351442042、363495278、375553019、383400710、390469516、396533215、397753012、401574339、401783978、406500645、408866831、409429625、412020155、413066356、416646002、417059585、420444403、421675699、425498293； 206～315：chr4A：5868933、8392393、19170174、19413350、25203745、25791291、28906638、30909572、31909139、36204577、37380881、37931499、51111451、56156245、59101899、61464368、73797069、74531320、89017088、90449403、92562971、104373841、111027202、111827939、111827957、115429197、117630111、121222702、135528254、136756326、137303694、139458951、159197158、161232316、163502837、168263215、170902690、171546185、177665690、187622384、195349317、197153086、207347401、208573136、222610526、222636708、231242768、231548094、235503941、241192849、241509123、247748826、248060825、248060830、248060889、252537773、254613235、257416765、258885798、259540777、262281263、272630002、277190662、281486838、281486849、286266765、288431566、292131290、292513321、295102035、297733585、297733643、300315368、300315381、300911283、301288818、303316574、306582903、314745375、314898344、315417088、315667578、321573717、337131944、350536261、350844103、359359746、359722506、359913387、362273696、362389355、373922766、374896108、378137144、378327427、396386903、401387124、406637920、413326636、425504487、426661755、430055295、438016051、445440228、446148292、448993225、457195088、460557686、462487598、463183142； 316～400：chr5A：1050490、6249598、7506416、8169576、11188916、14219787、16763198、19760395、23929408、36864940、37550369、45985582、69234885、78292272、82260577、83281867、95237393、97956121、104955266、110334622、120926145、121559563、132558985、133652751、147940962、148642661、151761466、154638018、159611159、162603151、182070963、188791902、192242039、203887430、217563535、222610538、231784772、240240115、252125842、257069571、261461273、262622135、271782223、284460811、287368033、292599093、298428508、305834482、316407299、317157082、322409847、322628089、324921979、325590714、330742245、340587172、344360993、351428308、361091415、377099210、380140169、384387808、384603300、396589627、401935107、403229343、403653144、410271145、415954782、416310066、420705569、430922569、441265600、449223765、450584555、450812613、462189418、462239914、464203725、468371869、468525614、475372538、476139251、478200125、479550901； 401～518：chr6A：62544、1012565、2455651、4470187、6997843、14405410、25578536、27379598、36452576、47261547、67456872、79634441、79883573、84507176、89303453、102016887、112552215、114422148、136429929、140069943、143659807、145601973、151055903、160914806、161540800、167462123、171606982、172156007、179427239、182498507、184441253、204321087、208540939、218759115、221171302、221171322、221371867、235141870、237187254、240828531、248879987、251864596、256825845、265718194、268002672、270603498、272991361、273394310、276951871、278083452、280051916、281852704、282437075、282736688、291049042、292332589、293675810、295680498、296239414、300620942、303761972、306859388、307122944、309068192、310869491、311384412、314918405、319443489、320079085、322530700、323175189、327428291、328029972、328227917、329136897、329906417、331238195、332637344、333020015、333340362、335833836、336030537、338431953、338607425、339431942、345968451、348836682、350217335、353989225、364663392、366460907、367790255、371604445、376988529、377585368、380245259、381323139、382680956、383227089、389290139、392079421、395939625、396134837、407009969、411379388、416884003、419204760、419212286、426934823、427650829、429461357、432083274、435221528、443546030、444718017、444743716、445852336、445852368； 519～589：chr7A：30299、797283、797351、5133297、7465119、9946073、11793802、15395939、17639035、19586651、26415871、43862820、45486520、47295123、49441855、54545600、55393233、57362711、58949123、61794447、62338021、63223946、64882556、65060462、65251259、71731013、84829439、86301312、86620598、93221864、94326878、100414766、103910393、114754034、120852435、125629877、135463951、136261080、139430971、140133058、147126394、154304327、161938874、162275342、162502546、222831530、230712620、230740407、251804505、252376556、253119579、296660241、361193782、388782436、395213388、396086697、400673360、423577618、448686669、452001562、461430759、468784757、474082282、480336404、481051356、485992955、487562251、488323297、490272719、490579940、491985052； 590～642：chr1C：794398、4966766、7517239、9316840、9358859、9447742、12025749、12728231、12975605、13286580、16386903、18440468、18644571、18829239、19622398、23813998、24351415、32333223、33013849、36097965、41500803、49149059、98433026、100225401、117648056、139862140、152181613、242734065、248887909、289524498、315674850、315921561、334542237、344894647、345768079、346038665、359261969、359832872、376528494、378345831、388388717、391800413、401337969、403086414、403786769、414634423、422023895、428386505、429393098、434959354、442827296、452742922、459071471； 643～722：chr2C：508638、1877188、2528207、3608980、6505327、8828258、9887223、16378340、16733830、21493372、30722539、32260907、34107248、42159271、47793038、55255692、58911330、67802606、76314393、79276831、88682059、91534141、91590749、130168941、130251230、144497831、161151777、161170416、161304339、173271478、179895203、189771395、223652458、247885154、254177797、259217358、271206331、277209877、282431123、320998183、325533604、336227470、336324599、336381796、345555907、349979246、361507264、367642842、373755255、379192574、381147253、382271246、396735565、400251049、401021912、408106436、412994796、428678286、431244629、449477697、466757749、493956422、499095023、501293309、502692609、508579710、519003218、520403117、522658623、531147422、533441899、534490497、535320919、537908978、543511967、550187082、554997859、558619184、560382933、562917658； 723～805：chr3C：61297、503695、598700、1201004、3394935、3394976、4103786、6165989、9922423、11627911、13906284、21931547、29629809、29955580、30791312、33847452、42483315、43861523、46984198、47170559、61358625、67823801、69552871、73650387、85817742、89054677、133070875、160667478、165150659、177812668、191447376、193827038、207598037、228857205、240224728、273109399、275506686、276817356、300505682、308926287、335084217、340272306、357039534、360384970、375228068、397621834、409004632、417466913、426577766、427727313、434921481、447033212、452211758、456779390、462944359、464786184、466302827、489683019、499309825、501522818、523737122、550827482、551112909、564770145、571627226、593909720、595004344、597544696、604657715、607082129、607902694、612599972、613269859、614722449、614823779、620371982、623382558、626791784、627443314、628928880、630346501、632651708、638133888； 806～918：chr4C：3156275、3156309、6151866、11154035、26834888、30694671、36293580、39086177、40288786、42236043、43109627、43848590、47392406、47641679、49158016、52760842、53598521、53939843、58316218、59961826、60096926、62416393、64784388、69604919、70450484、73378379、83748627、103386515、107244878、107330999、108482037、118792713、119239746、121940137、122327356、123510068、124053384、126900382、128226873、130464152、131337543、135871755、136394936、137398743、139983786、142766414、144128859、149693472、151667321、158587013、159537214、168296059、171843825、172869591、177332803、188589498、188815342、194106449、194117303、208025980、232058561、232313275、233414178、243942384、246993956、277770184、335855729、341048610、355301777、358590152、359548305、380344060、390159929、393180518、398088959、402898771、403502507、410722151、416930608、442743332、443020917、453953122、488144957、493824659、509539196、512906902、518164512、525011469、525018986、525845028、546203479、558810054、564981985、565345449、568926820、575890407、597642698、606728798、625266556、633582863、670582073、671502734、676162180、684407156、692454211、696599915、698128769、698161356、700308139、704691850、706603391、709770857、710256791； 919～1044：chr5C：554202、3749792、3849936、7637563、9034502、12288161、12428473、15702114、16919102、19035849、19684941、34039963、38195971、41475312、47425662、53774061、53798541、53937809、60895738、62177980、63445568、64638626、64699517、68936987、87785914、90707249、93155853、97074885、98370861、98818134、105238445、107890566、108958735、115464154、116215262、126465885、130714668、146124820、148156344、150181347、156346016、161589949、170232433、170265452、181486109、181698549、190217791、212065553、224669563、240501203、249105387、264893757、275312253、290424574、313738041、325535102、338862900、340776106、346453345、346670057、360877555、369746847、370916238、376791265、377444427、380137077、383843868、391113723、399409221、400559622、407090768、408955951、409877500、411853930、412309560、422660477、427953795、429536327、433178666、437980316、438986627、439244384、443400619、449027771、459155181、469127358、471266768、475881780、485797166、490197664、493250155、502265146、504791556、505908673、506958259、508142521、511148919、513278340、514868949、517911508、519788490、523051612、533055170、544767033、549076111、550648593、553113006、553385567、557268792、563355183、564881004、569327026、572145755、572145791、581326964、584056057、590337215、595946882、601502958、606333257、606918814、610040984、611215306、612022343、612942538、613031851； 1045～1237：chr6C：3360302、4350869、4932310、5277621、7754285、8593394、23983484、25516860、27157177、28040770、32132844、35586904、35586974、36103399、37264411、47620214、51093616、53478089、61270790、62774418、62774508、65346528、66265528、68807067、71948109、74143042、86360213、90807037、100565028、105893326、107564980、111533955、113441009、115816527、123515378、123829932、125254623、128366562、131095916、141348221、144266889、149851686、153941728、154627558、163061787、163718401、168791300、175779829、180047936、182114010、182148927、185422948、185510831、185510842、187860000、188015604、200549497、202069843、208001681、208264410、208789832、209243891、209794718、211567909、211567992、212122148、214117823、228168286、229007541、231354909、231440504、236321429、241558979、242439816、242439849、243761709、247960808、253703197、259950029、267023629、269236695、279642437、280269608、282091119、285290859、290195093、294280244、296108433、296151607、296749043、297048385、297390218、298825148、299106924、312595097、314363926、314484553、320920928、322432467、325988513、326067226、331000408、333453880、333817680、333843521、341392424、341602867、342467150、352543596、352688195、354241895、361471158、363958670、365037839、386547357、388310966、391715451、395417260、398916813、402914237、412660307、413568227、424163261、429747892、442377446、442833450、445939991、453619415、454613425、461323879、463705554、466436641、466640395、470683625、485083599、490527343、494793165、498466125、499420835、505976028、510124456、510814068、511862138、513159581、523605012、523752016、524930246、526593071、528061670、529050405、533292145、533292168、533383364、533906881、537589325、540321220、540321291、541273513、543178314、545406727、545406821、555175028、561042608、566217156、568123645、570160049、570636165、575904696、580979024、581757331、581998214、587382947、595591783、601918078、603809955、605525359、605819832、606586959、608845375、610237906、610448989、610796208、612119763、614815629、615197400、620149276、622349425、623215985、623215987、624048923、624734309、624734322、625301507； 1238～1328：chr7C：1837898、2199518、3266542、4023199、7667076、8378814、19054935、24336059、26900380、38237201、41431078、43663497、44271391、50074554、52936464、54056524、57445019、60390318、61328257、74651850、75633576、80195974、80963688、82037659、84942319、87031454、88355213、89836426、90534162、90534234、91868420、92284011、95186313、96840627、97910653、100850974、103124523、108091562、142549489、144028476、152180231、155823992、165853418、184399176、192742152、224735147、262536122、271932318、272185938、272762809、293413597、294514478、303692756、314775121、336307083、339370302、343787557、347324923、365012556、366352205、383214632、385907184、394905236、402735312、443651331、452069295、453470984、456083674、481302865、497984044、515874361、529222932、530934528、533888689、535328997、537725597、537961172、541891943、541891949、542181045、543270953、544000557、544560923、545226352、545495454、546165378、548240499、549283342、550510685、551709679、551717893； 1329～1468：chr1D：2472108、2763296、6008789、9289749、10777024、13071780、15573885、22743758、28309513、28695982、29511718、34581984、40284363、40923696、42956217、43708591、44780684、45137946、51730344、54094919、55921214、61866244、64294194、65831128、68821548、72441042、74263335、76064584、78204798、81107048、82907066、85473604、87752359、90710231、93886779、101146104、105935958、109701762、118151136、120227503、125961341、126769804、129180085、132945644、132945664、135707309、141273940、144431592、149206540、150743912、153352539、154498503、162009883、162122649、164954116、167974831、168181978、170515053、173334238、177087356、180812692、181477217、182678841、185365277、187332483、190844598、208165315、238821603、246640567、249534966、269793107、279157022、297671371、305616514、306303753、308911527、310605052、316140032、317366109、323437400、326063088、327171559、327337249、333946245、335252519、337064441、344763160、346103369、347106295、348239378、349973298、352580647、355033090、355671612、362260658、362260792、370361856、373917305、375149492、376585987、378325233、380205234、385946522、386686765、386695328、387663636、393395423、394002709、398509223、399261806、406058505、417146864、420186032、425743135、433463172、433821555、434538143、436587940、437015611、437072201、437806624、439566446、440494209、446890370、447747018、447968126、451479068、453212346、455964242、461430019、465668254、470897750、473422693、475010970、475992716、478296618、479510735、479510759、479837889、484202525； 1469～1558：chr2D：4299081、6576682、7939906、8879735、25226872、25606770、28124073、29403920、31747759、35544923、36930852、38598148、39124581、40320810、60479331、61200152、61764990、63504731、66037015、68539636、72374382、72801418、75466908、85173718、97289693、97381351、100239493、102266911、104173506、111830406、124395524、125143812、127916002、129759198、139688996、147678453、149731658、150787737、154522423、156989872、160718930、160718983、164510104、167362478、168381966、168772578、169092119、173305350、176071219、188891939、196307317、196573569、200604526、204803324、217180387、221379579、223132394、229493777、245092057、258860376、266050457、269849936、304765446、313434878、316274959、316275047、318310631、341208220、397683112、425534524、429435773、439808678、470936426、476460687、477845930、495124480、508957795、510305795、513084570、514503617、518005448、521057369、521517068、523929499、523943553、524067993、527883400、531744996、532085894、532086148； 1559～1627：chr3D：7537059、7907346、9947897、10447064、14634248、15206447、19692269、28080785、35200774、45343435、48884333、52486495、54516812、65417650、74990279、76161058、93385358、107523050、107523132、118573098、119936647、149799762、199922500、224927766、236839180、287199373、303913397、324806982、326788707、337367716、345565226、347275925、360122324、362214749、364820238、377020875、382788379、383074462、393009205、399445661、406655585、408964857、420800669、429099312、434455330、439798196、444819830、449582558、453131736、455945456、456707829、458731719、461606368、462709025、463341020、463624031、464968253、465156231、465456066、467856832、467856844、469116316、474406617、474406681、474406761、474502067、477648265、477966906、479929633； 1628～1718：chr4D：11485004、14717658、15065859、31961722、32485235、33560371、35156356、39740867、42795157、44433053、59143960、61439239、78867509、83710252、94577427、97342443、99630391、102329405、114879597、135083886、138944406、139191630、145275183、158199248、183847307、197618490、202008461、208924184、214257428、217116193、218226761、220722019、224527103、226305656、242931934、249581054、255462900、264284840、267548200、268330950、271337080、272128244、274673552、277597999、284757400、292115085、295208268、307122231、312785806、315358650、320106105、321257483、322335201、331354099、347449985、349565426、355005406、355529054、357699853、363770741、375262472、377476161、380726205、385800811、391193802、394067252、394991049、398011595、398021682、402631607、403614105、404368909、407333043、410646224、412188909、414401279、418371869、418997245、421372071、421555572、428897486、430839695、432215688、440437664、441165072、443760645、446977976、448126463、451246460、453204068、454964761； 1719～1790：chr5D：422491、2403544、2847753、8070862、9173118、15344875、20080029、20241303、23719531、24894899、42951694、44107567、48815715、49508914、51945197、56013951、62539497、149532814、182274396、224230643、244783821、258584112、274219604、300870135、312225241、324387095、334868009、336719110、346038010、346469081、346469183、354514206、366731773、378137934、379881301、380071905、392150519、396806532、401607567、401827548、403566921、407953083、414598189、418669755、418689444、420799211、425328381、436638413、438696800、438952723、445810673、450854676、455970239、459069234、460850708、460986821、471757307、472785728、480109072、484436332、484877489、487723676、489342416、490270563、491681200、492912927、494028859、495132865、495470919、495962366、497177907、498614358； 1791～1842：chr6D：2682247、4232838、4870848、5106374、5438355、8149967、9044749、16567192、21833434、25107483、30733743、31648517、35568291、37263838、38266044、42699055、47536590、82721650、111693433、111859680、122698189、143238944、150943424、162140158、167080037、167154453、192530085、193391439、199476613、206222045、213515826、230263674、239136051、243811626、244217054、253294894、256771000、259859605、272370825、273611234、283670850、285381472、286820765、289202530、290801536、291677712、292070963、292447424、294444168、294755480、296249886、298013338； 1843～2000：chr7D：1072783、1119801、1236244、1534371、2991626、6484731、8526949、12785153、16242070、17366942、17850661、22956474、24096794、28468246、36005342、36246561、38201748、44727899、51458782、52893291、54121226、57516030、57516038、67534447、70410781、71268375、74183904、77122480、80597019、80953710、91190332、97784606、101125798、101646423、103077178、107623530、109736013、109968936、109968972、115007259、118525929、122982073、128880373、129122344、130575310、144416893、144696534、147934872、151212412、156658652、159001645、159202650、161327586、163948311、181525332、182392553、185716424、192236268、197083938、200305527、200305588、203992071、205384321、207873222、211308312、213859261、215658345、221747688、227132133、237365568、238457399、240373853、240497344、251811510、252160256、257692302、265633476、276461950、281656816、281673877、281673955、282186605、288940800、289015491、295863972、297712659、300964765、301738058、302186316、305064006、305958757、309078989、309792985、310443347、311730518、317299513、318083871、320706656、327935646、330094148、334523638、334550921、335532754、339511013、341280805、348832923、348856568、362000098、371871465、374671605、379217936、381999320、388319071、392108332、403165236、405370611、412711051、412974598、423689553、425896659、434160829、434379013、435977775、437395621、445058667、449281896、452187250、455142358、462212286、466485714、469010673、469111622、469111697、474002520、476702195、479594709、480535689、483206258、488775954、493156510、493471148、495673345、497521926、503762348、506063835、507610286、508855720、511766848、512617462、514968304、515513948、516813821、519702746、520048073、521311574、524439726、525367002、527908773； 其中，chr1A、chr2A、chr3A、chr4A、chr5A、chr6A、chr7A、chr1B、chr2B、chr3B、chr4B、chr5B、chr6B、chr7B、chr1C、chr2C、chr3C、chr4C、chr5C、chr6C、chr7C、chr1D、chr2D、chr3D、chr4D、chr5D、chr6D、chr7D 表示SNP位点所在的染色体ID，染色体ID后面的数字表示SNP位点在染色体上所处的位置。

2.根据权利要求1所述的一种燕麦50K SNP靶向捕获探针，其特征在于，所述探针的5’端带有生物素基团，所述探针通过C12分子臂和氨基修饰偶联在荧光微球上，每个荧光微球偶联一种探针。

3.权利要求1所述的一种燕麦50K SNP靶向捕获探针的制备方法，其特征在于，包括： 步骤1：筛选燕麦50K SNP位点； 燕麦50K SNP位点通过下述方法筛选获取： 步骤1.1：根据多份燕麦种质的重测序数据，比对燕麦参考基因组检测所有样本基因组上的SNP位点，用于目标SNP位点的挑选； 步骤1.2：根据开源的简化基因组测序数据，比对燕麦参考基因组检测所有数据中的SNP位点，用于目标SNP位点的挑选； 步骤1.3：根据燕麦6K芯片位点，挑选目标SNP位点； 步骤1.4：根据公开发表的燕麦功能性标记位点筛选SNP位点； 步骤2：设计并制备燕麦50K SNP位点探针。

4.根据权利要求3所述的制备方法，其特征在于， 所述目标SNP位点按以下标准挑选：MAF≥0.05，NA<5％，杂合率<5％，染色体均匀分布。

5.根据权利要求3所述的制备方法，其特征在于，所述燕麦50K SNP位点探针的设计过程为： 步骤2.1：确定探针设计原则： 探针长度120bp、探针GC含量在25％～69％之间，同源性区域个数≤3，选取区域最大限度地不包含SSR和GAP区域；结合染色体均匀分布原则； 步骤2.2：然后以步骤1获得的SNP位点为中心，筛选其左右120bp中GC含量最接近45%的120bp核苷酸序列作为探针； 步骤2.3：根据步骤2.2筛选得到的120bp核苷酸序列合成5’端带有生物素基团修饰的单链DNA，得到燕麦50K SNP位点探针。

6.燕麦50K SNP分子标记、以及燕麦50K SNP位点探针在燕麦50K SNP靶向捕获探针制备中的应用，其特征在于，所述燕麦50K SNP位点探针是根据燕麦50K SNP分子标记合成的单链DNA，所述50K SNP位点包括权利要求1中所示的核心SNP分子标记。

7.燕麦50K SNP分子标记、燕麦50K SNP位点探针在以下任一项中的应用： （1）燕麦遗传多样性分析； （2）燕麦分子遗传图谱构建； （3）燕麦全基因组关联分析； （4）燕麦品种真实性鉴定； （5）燕麦分子标记辅助选择育种； （6）燕麦全基因组选择育种； 所述燕麦50K SNP位点探针是根据燕麦50K SNP分子标记合成的单链DNA，所述50K SNP位点包括权利要求1中所示的核心SNP分子标记。

8.权利要求1所述的燕麦50K SNP靶向捕获探针在以下任一项中的应用： （1）燕麦遗传多样性分析； （2）燕麦分子遗传图谱构建； （3）燕麦全基因组关联分析； （4）燕麦品种真实性鉴定； （5）燕麦分子标记辅助选择育种； （6）燕麦全基因组选择育种。

请联系平台

请联系平台